「吹き抜けがある家にしたい。」よく聞く言葉です。
上下階に繋がりが出来ますし、明るく開放感のある気持ちの良い
空間がうまれますね。

しかし、安易に吹き抜けを設けるのはどうでしょうか・・・
保温性について・・ex)熱が吹き抜け上部にこもり、下部はなかなか
暖まらないのでは？
掃除について・・ex)吹き抜け部分の届かない場所の掃除は？
構造について・・ex)柱や壁、床がない分、耐震性は大丈夫なの？

正直に申し上げます。寒くて掃除がしにくく、耐震性に不安
（木造2階建に限ります）がある吹き抜けの家というのは結構あります。
これらは設計の段階で慎重に検討を重ねなければなりません。

対策はできるの？

保温性に関しては、床暖房や的確な暖房器具の選定、シーリングファン
などでほぼ解消できます。また、吹き抜けでつながる部分を屋内サッシなど
で区切ることでも改善が見込めます。
掃除に関しては、こちらの物件のようにブリッジを設けるのも一つの手です。
構造に関しては、信頼できる設計士に依頼をして、構造計算されていれば
問題はないでしょう。
それでも、完全に解消されるとは言い難いのが現実。
メリット、デメリットを踏まえての入念な検討が必要です。